La nouvelle version de BioConductor est sortie le 31 Octobre : c’est la 3.8. Elle nécessite une version de R 3.5.0 ou plus. Le point important est que la version de flowCore (1.48.0) corrige certains bugs d’écriture de fichiers FCS. Si vous avez eu des bugs d’écriture de fichiers FCS, nous vous encourageons à effectuer la mise à jour de R et de Bioconductor. Sinon, vous pouvez continuer à travailler avec votre version. A noter, il est possible d’avoir plusieurs versions majeures de R (par exemple R3.3 et R3.5) sur le même ordinateur et de choisir dans RStudio la version à utiliser.
Du fait de cette sortie, nous partageons les scripts d’Anne-Sophie qui permettent de corriger un bug d’exportation de fichiers FCS depuis FlowJo. Ces scripts de ré-écriture de fichiers FCS sont aussi l’occasion de se lancer dans l’utilisation de quelques commandes R bien pratiques.