Les fichiers FCS exportés de FlowJo sont parfois incorrects : ils ne contiennent pas les mots clés $BEGINDATA et/ou $ENDDATA imposés par le standard FCS 3.0. De ce fait, ces fichiers ne sont pas compatibles avec CytoBank par exemple. Comment résoudre ce problème ? On va utiliser quelques lignes de R pour lire le fichier […]
Principe Citrus réalise une analyse supervisée en utilisant plusieurs individus. Les individus forment des groupes distincts (comparaison de 2 groupes ou plus, style t-test ou ANOVA) ou sont associés à une variable continue (dosage ou survie). L’objectif de citrus est déterminer des ensembles de cellules qui sont reliés au regroupement ou à la variable continue. […]